自然界中存在著大量的微生物，通過附著植物、塵埃、空氣等污染食物，若吃了被病菌污染的食物，將影響健康。細菌微生物檢測儀適用于表面潔凈度的測定和微生物生長的控制，利用化學反應法測定ATP，利用ATP采集標本。ATP樣本在緩沖液中浸泡，以幫助從干燥或潮濕的表面上提取生物體。

微生物污染食品后，若環境條件適宜，可分解蛋白質、糖類、脂肪、維他命、無機鹽等營養素進行自身繁殖，其營養價值和品質下降，嚴重時會引起食品腐敗變質，在一定程度上具有令人難以接受的感官特性，如刺激性氣味，色變、組織腐敗、產生粘液等。另外，一些細菌污染食物后還會產生一些毒素，比如肉毒素，金黃色葡萄球菌腸毒素等，如果不小心食用，會引起人體中毒，嚴重危害人類的健康，甚至可能危及生命。所以要用細菌微生物檢測儀檢測食品中的細菌，確保人們的食用安全。

對食物的細菌檢測一般采用培養基法，指食品經處理，在一定條件下培養，得到1g或1ml檢樣中的細菌菌落總數。菌落總數是判斷食品是否受污染程度的重要指標，也可運用該方法來觀察食品中細菌繁殖的動態，為衛生鑒定提供依據。也可放置36±1℃的溫度箱內培養48±2h，使用細菌微生物檢測儀，無需樣品處理，可直接顯示全部細菌(CFU)。運用衛生監督和衛生防疫保障措施，檢驗醫院部門的消毒質量，食品、飲料、污水處理廠、金屬業、油品企業等，出入境檢驗檢疫機構。方法簡便，便于攜帶，出藥率高(15分鐘)，并能直接顯示菌數。